O tratamento da miocardite deve ser adequado aos sintomas e ao impacto da doença na função cardíaca. Normalmente é monitorizada a frequência cardíaca e restantes sinais vitais em regime de internamento e pode ser necessário administrar oxigénio e medicamentos endovenosos.

Consoante a gravidade da apresentação clínica, o tratamento farmacológico pode incluir: fármacos diuréticos e outros que baixem a tensão arterial, para reduzir o esforço do coração e optimizar a recuperação do músculo cardíaco; anticoagulantes, de forma a prevenir a formação de trombos intracardíacos; tratamento de eventuais arritmias; administração endovenosa de fármacos do grupo dos inotrópicos, que potenciam a função do coração, ou mesmo utilização de dispositivos externos que substituem temporariamente a função do coração, necessários apenas nos casos mais graves e em regime de cuidados intensivos.

Recentemente, têm sido propostos vários tratamentos que visam interferir nos mecanismos que estão na base da doença. Destaca-se a administração endovenosa de fármacos imunomoduladores, que alteram a função imunitária e que têm o potencial de reduzir a inflamação do músculo cardíaco, principalmente após a fase mais aguda da doença. São exemplos deste grupo: anticorpos, corticóides e imunossupressores mais específicos. A administração de antivíricos também pode ser benéfica, em casos selecionados. O desenvolvimento de uma vacina que proteja contra a infecção por determinados vírus, mais frequentemente implicados na miocardite, poderá contribuir decisivamente para o combate a este tipo de miocardite.