Todos os casos suspeitos devem ser isolados e vigiados rigorosamente durante pelo menos 21 dias.

Os doentes devem ser isolados em unidades/recintos exclusivamente destinados ao tratamento da doença de Ébola ou, no mínimo, quando estes não foram instalados, em quartos afastados dos locais de circulação normal dentro do hospital. O ideal, utópico para as regiões que geralmente são palco da doença, é a disponibilização de salas com pressão negativa e proteção respiratória.

Para prevenir o alastramento na comunidade é essencial:

Criar estratégias para que os casos suspeitos sejam rapidamente identificados e isolados, a saber:

• Só dar alta após passadas pelo menos 48 horas àqueles a quem o diagnóstico foi confirmado e melhoraram com as medidas de suporte sem qualquer sintoma da doença e negatividade da PCR;
• Identificar os contactos, que devem ser mantidos sob vigilância (observação e avaliação diária da temperatura corporal durante pelo menos 3 semanas);
• Reforçar as medidas de prevenção e controlo de infecções nosocomiais e comunitárias - todo o pessoal de saúde deve seguir com extremo rigor as normas estipuladas para lidar com sangue e fluídos corporais altamente contagiosos, equipando-se com máscaras, óculos protetores, luvas, bata e botas, devendo este tipo de proteção estar também presente no manuseamento de cadáveres e todo o equipamento médico;
• Restringir os exames laboratoriais ao mínimo essencial (as análises ao sangue devem ser feitas em áreas de acesso restrito), alertando todo o pessoal do laboratório para o elevadíssimo risco de contágio;
• Equipamentos e outros materiais com que o doente teve contacto devem ser esterilizados por autoclavagem ou fervura;
• Em caso de morte, o corpo deve ser desinfetado de imediato (regar com hipoclorito de sódio a 0,5%) antes de ser transportado, e rapidamente enterrado por uma equipa preparada para tal;
• Familiares, amigos e vizinhos não devem proceder à lavagem dos cadáveres nem realizar rituais suscetíveis de pôr em risco as suas vidas;
• Convalescentes de infecção pelo vírus ébola devem abster-se de relações sexuais (vaginais, anais ou orais) ou ter sexo só com protecção durante 3 meses ou mesmo até 12 meses após o início dos sintomas, ou até dois testes negativos ao sémen, realizados numa periodicidade mensal;
• Aconselhar os viajantes a evitarem as áreas e ou os países onde a doença está confirmada ou sob suspeita
• Caso os viajantes já estejam nas referidas áreas ou países, devem ser aconselhados a não ter contacto com pessoas infectadas;

• Todos devem também manter-se afastados de primatas não humanos e suas carcaças e morcegos;

• Devem também evitar comer carne de primatas (macacos, chimpanzés…) e morcegos.